CEASaclayNon précisé
Les biotoxines sont des protéines composées d’une à deux chaînes polypeptidiques, dont la masse moléculaire est comprise entre 30 et 150 kDa, produites par des bactéries ou par des plantes. Elles se caractérisent par une toxicité importante, une action rapide et une grande diversité de séquences protéiques (nombreuses isoformes, types et sous-types). En cas d’intoxication due à une contamination accidentelle ou à une éventuelle attaque bioterroriste, les soins hospitaliers se limitent au rétablissement des fonctions vitales car il n’existe pas de contre-mesures médicales spécifiques capables de neutraliser chaque biotoxine. Il est essentiel de développer de nouvelles contre-mesures médicales, notamment des anticorps monoclonaux (mAbs) neutralisant les biotoxines.
La caractérisation structurale des biotoxines et l’identification des séquences peptidiques (épitopes) reconnues par les mAbs sont des prérequis lors du développement d’anticorps thérapeutiques. Dans cet objectif, vous concevrez une nouvelle méthode HDX-MS (échange hydrogène/deutérium couplé à la spectrométrie de masse) pour étudier les changements conformationnels de la biotoxine ciblée. Pour des raisons de biosécurité, des toxoïdes (formes non actives de la toxine) seront utilisés à la place de la toxine native.
La 1ère partie du stage consistera à développer un protocole de digestion des toxoïdes, afin de maximiser la couverture de la séquence protéique. Pour ce faire, différentes enzymes (pepsine, nepenthesine, protéase XIII et leurs combinaisons) ainsi que des tampons et des additifs seront évalués. Puis une optimisation chromatographique sera réalisée en comparant différents diamètres de colonnes (micro, capillaire et nano) ainsi que différentes phases stationnaires. Finalement, la méthode sera évaluée en termes de couverture de la séquence protéique des principaux types de la toxine et de stabilité de l’incorporation du deutérium, avant de l’appliquer à des analyses conformationnelles
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Localisation du poste Site
Saclay
Localisation du poste
France
Ville
Saclay
Demandeur Disponibilité du poste
01/02/2027