Adlin-ScienceParisHybride
Contexte
Notre équipe développe PHAREOM, une plateforme multi-omique intégrant des pipelines d’analyse transcriptomique, génomique et protéomique, ainsi qu’un volet dédié à l’identification de biomarqueurs. Dans ce cadre, nous recherchons un(e) stagiaire de Master 2 en bioinformatique pour nous accompagner dans la consolidation de nos pipelines biomarqueurs et de leur processus de validation.
Missions principales
Le/la stagiaire participera activement à la structuration et à l’industrialisation du volet biomarqueurs de PHAREOM. Les missions incluront :
→ Identification, téléchargement et structuration de plusieurs jeux de données de référence multi-omiques.
→ Test des pipelines d’identification de biomarqueurs (approches statistique et apprentissage automatique) sur ces jeux de données.
→ Test d’autres pipelines d’analyses omiques, selon les besoins de l’équipe et l’avancée des développements.
→ Développement de briques bioinformatiques selon les besoins.
→ Contribution à la mise en place de démonstrations représentatives des capacités de la plateforme en lien avec l’équipe Business Development.
→ Documentation du travail selon les conventions de l’équipe.
Votre place dans l’équipe
Vous serez intégré(e) dans une équipe de bioinformaticien(ne)s aux expertises complémentaires, et travaillerez sur la partie R&D de notre plateforme d’analyse multi-omique.
→ Master 2 en bioinformatique, biologie computationnelle ou data science appliquée aux sciences de la vie.
→ Bonnes bases en génomique et/ou transcriptomique et/ou protéomique.
→ Maîtrise de Python et/ou R ; expérience avec un gestionnaire de workflows appréciée.
→ Notions de conception de bases de données.
→ Autonomie, rigueur scientifique, goût pour la documentation et le travail reproductible.