CEAEssonneNon précisé
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachementLe CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat. Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs. Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international. Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :
Référence2026-41137Description de l'unité L'institut JACOB regroupe plusieurs départements dont le Genoscope et le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) situés à Evry. Ces départements mènent des projets de recherche propres et produisent des données de séquençage à haut-débit pour des projets collaboratifs hautement compétitifs.
Le Genoscope mène des projets de génomique environnementale pour l'exploration de la biodiversité. Après avoir participé au Projet Génome Humain, c'est un acteur majeur de la génomique en France, notamment dans le développement de techniques de séquençage massif d'ADN et d'analyses bioinformatiques.
Le Genoscope est implanté à Evry (91), 30 km au sud de Paris.
Description du poste
Domaine Sciences du vivant
Contrat Stage
Intitulé de l'offre Stagiaire en biologie moléculaire et microbiologie H/F Février 2027
Sujet de stage Le projet DYNAMO-RNAP s'appuie sur CREPE, notre plateforme propriétaire d'édition génomique à haut débit basée sur CRISPR-Cas9, ainsi que sur des systèmes automatisés de culture continue et le séquençage de nouvelle génération (NGS), afin de générer une cartographie complète de l'impact des mutations, à la résolution d'un résidu, sur la fonction de l'ARN polymérase. L'étudiant(e) de Master 2 sélectionné(e) jouera un rôle central dans le déploiement à grande échelle de cette approche de Deep Mutational Scanning (DMS) afin de décrypter de manière systématique les interactions allostériques au sein de l'ARN polymérase.
Durée du contrat (en mois) 6
Description de l'offre
Les principales missions seront les suivantes :
Clonage à haut débit et génération de banques de mutants : construire des banques exhaustives de mutations génomiques localisées et sans cicatrice (scarless) chez Escherichia coli.
Sélection automatisée : utiliser des turbidostats de culture continue de dernière génération afin de réaliser des expériences de compétition parallélisées dans des conditions contrôlées de carence nutritionnelle et/ou de stress.
Séquençage profond génotype-phénotype : préparer et analyser des banques de séquençage d'amplicons à grande échelle (Illumina NovaSeq) afin de suivre l'évolution de la fréquence des variants au cours du temps.
Modélisation intégrative des données : exploiter Python (Pandas, Matplotlib/Seaborn) ainsi que des outils d'analyse structurale afin de comprendre l'impact des mutations sur la fonction de l'ARN polymérase.
Profil du candidat
Nous recherchons un(e) étudiant(e) ambitieux(se) et très motivé(e), actuellement inscrit(e) en Master 2 ou en école d'ingénieurs, avec une spécialisation en biologie des systèmes, biologie synthétique, microbiologie moléculaire, bio-ingénierie ou biotechnologies.
Compétences recherchées :
Compétences techniques (souhaitées, une formation sera assurée) : expérience pratique des techniques de base en biologie moléculaire (PCR, assemblage Gibson, transformation bactérienne).
Compétences en analyse de données : une connaissance de Python et/ou R pour le traitement de données constitue un atout.
Langues : bonne maîtrise du français et de l'anglais.
Pour toute information complémentaire, veuillez contacter :
Alaksh Choudhury
achoudhu@genoscope.cns.fr